Em 1993, a Santa Casa Monsenhor Guilherme era o único Hospital que atendia a área de pediatria através do SUS, porém não havia estrutura para atender toda a demanda advinda da Tríplice Fronteira e a migração de outros estados. De acordo com depoimentos de pessoas e funcionários da Santa Casa, havia um alto índice de crianças desnutridas internadas naquele período. Esses pacientes após receberem alta clínica e hospitalar, ainda necessitavam de acompanhamento e tratamento nutricional. Entretanto, eram encaminhadas para a continuidade do tratamento em casa, dada à estrutura insuficiente da época para atender essa demanda específica que requer tratamento de medico a longo prazo. O Centro de Nutrição Infantil de Foz do Iguaçu (CENNI) foi fundado em 8 de setembro de 1993, como é uma entidade não governamental e idealizada por um grupo de profissionais e voluntários, os quais avaliam a necessidade a partir do diagnóstico da realidade social, cultural e econômica da tríplice fronteira, motivos reais para a fundação do Internamento do CENNI.
À priori, focou-se na desnutrição infantil que se apresentava como problema universal de saúde pública, trazendo consequências em muitos casos irreversíveis ao organismo das crianças. O objetivo principal do Projeto foi propiciar meio de dar continuidade ao tratamento que se iniciava na Santa Casa, diminuindo consequentemente a reincidência nas internações que eram cada vez mais graves pois o problema principal era a desnutrição. Isso graças ao trabalho de prevenção desenvolvido pelo CENNI, Programas Sociais de transferência de renda, implantação de Equipes do Programa Saúde da Família (PSF), Programa de Distribuição de Leite (SISVAN), onde há a obrigatoriedade de acompanhamento mensal de peso e da saúde da criança, entre outros parceiros da rede. As características dos usuários do CENNI/FI são na maioria crianças provenientes de famílias com baixo poder aquisitivo, com desestruturação de relacionamentos, alto índice de desemprego e trabalhos informais, com hábitos alimentares inadequados, os quais podem ser culturais ou devido a suas condições socioeconômicas. Felizmente diante desses fatos, a instituição decidiu ampliar o atendimento multidisciplinar preventivo e de recuperação dessas crianças em situação de risco. Mantemos nosso internamento e ampliamos o atendimento ambulatorial, o qual possibilita hoje o atendimento de diversos distúrbios nutricionais que englobam tanto a desnutrição como as anemias carenciais, diarreias crônicas, intolerância a determinados tipos de leite, hábitos alimentares inadequados, doença celíaca, pequeno para idade gestacional (PIG) e obesidade, possibilitando, portanto, focar a prevenção dos distúrbios nutricionais e a promoção da saúde. Os distúrbios nutricionais apresentam-se como um problema universal de saúde pública, podendo trazer consequências cumulativas e irreversíveis. Pode iniciar-se antes do nascimento e afeta principalmente a faixa etária de zero a cinco anos de idade, período crucial para o crescimento e desenvolvimento da criança. Os atendimentos são realizados por uma equipe multidisciplinar composta por Médico, Fisioterapeuta, Nutricionista, Assistente Social, Enfermeiro e Psicóloga, regido por uma diretoria composta de voluntários.