IZSPB Molecular Biology & Bioinformatics

23/06/2022

L'Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Puglia e della Basilicata ha reso pubblicamente disponibili le sequenze complete del genoma del virus del vaiolo delle scimmie dei primi due casi identificati in Puglia, l'8 e l'11 giugno 2022. Il Laboratorio di Biologia molecolare dell’UO di Putignano, che ha effettuato le analisi, ha confermato che le due sequenze virali ottenute sono correlate a quelle condivise da diversi altri Paesi in Europa, Sud e Nord America e Australia nel contesto dell'attuale focolaio. Ad oggi, secondo l'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS) il focolaio avrebbe determinato oltre 3300 casi confermati in 42 diversi Paesi, la maggior parte dei quali Europei. Presso l'Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Puglia e della Basilicata sono in corso tentativi di isolamento in coltura del virus per effettuare ulteriori approfondimenti.
Questo importante risultato è stato reso possibile dalla collaborazione con la rete ospedaliera regionale e il Laboratorio di Epidemiologia Molecolare dell'Università degli Studi di Bari e consentirà di monitorare nel tempo l’epidemiologia dell’infezione.

06/02/2022

Il Laboratorio di Biologia Molecolare e Bioinformatica dell'IZSPB ha sequenziato la variante Omicron 2 (BA.2) da una paziente pugliese. Il Dipartimento di Prevenzione è ora al lavoro per tracciare i contatti della paziente e monitorare la diffusione della nuova variante.

Un ringraziamento particolare a tutta l'equipe del Laboratorio per questo importante risultato:

Antonio Parisi
Angelica Bianco
Loredana Capozzi
Laura Del Sambro
Domenico Simone
Giorgia Barbieri
Anna Giannico
Donato Ridolfi

Il nuovo ceppo è stato isolato sul tampone di una donna di 56 anni in provincia di Brindisi e un altro caso è in attesa di conferma in quella di …

18/12/2021

Isolata in Puglia la variante Omicron dall’Istituto Zooprofilattico Sperimentale: “adesso potremo avere informazioni fondamentali per contenere il virus” ...

18/12/2021

L'evoluzione della pandemia in Puglia a quasi un anno dall'avvio della campagna vaccinale.

Un breve confronto dei dati odierni con quelli del 17 dicembre 2020.

18/11/2021

Ecco il nostro ultimo studio sul COVID-19! Alcune mutazioni nel genoma di SARS-CoV-2 possono determinare un decorso più lungo e complicato della malattia anche per varianti non considerate particolarmente pericolose.

SARS-CoV-2 isolates from long-term COVID-19 patients play a significant role in understanding the mechanisms of infection and virus persistence. This study describes a SARS-CoV-2 isolate from a 53-year-old woman from Apulia (Italy), who was COVID-19 positive for approximately four months. In this pa...

12/11/2021

A little-noticed mutation in Delta allows the virus to stuff more of its genetic code into host cells, thus boosting the chances that each infected cell will spread the virus to another cell.

“Viruslike particles” open the way to safely study nucleocapsid and other viral proteins

07/07/2021

Covid, alla ricerca delle varianti: una giornata all’Istituto Zooprofilattico di Putignano

Siamo stati in uno dei principali laboratori regionali che si occupano del monitoraggio delle varianti Covid.

26/04/2021

L’Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Puglia e della Basilicata, sin dalle prime fasi della pandemia di COVID-19, ha operato in prima linea per il servizio sanitario regionale, nell’ambito del monitoraggio diagnostico e molecolare. In collaborazione con numerosi enti ospedalieri, l’IZSPB si è occupato del sequenziamento dell’intero genoma del SARS-CoV-2, da casi di infezione rilevati nelle due regioni. Ad oggi, l’IZSPB ha prodotto l’89% dei 756 genomi completi disponibili da Puglia e Basilicata, permettendo di monitorare, nelle varie fasi della pandemia, la diffusione delle varianti del virus, in particolare la B.1.177 (“spagnola”) e B.1.1.7 (“inglese”).
Il Laboratorio di Biologia Molecolare e Bioinformatica dell’IZSPB, coordinato dal Dottor Antonio Parisi, ha appena pubblicato sulla rivista Viruses una panoramica dei genomi sequenziati dall’inizio della pandemia fino a gennaio 2021. Questo lavoro fornisce una serie di istantanee sulle fasi della pandemia in Puglia e Basilicata, confermando il prezioso ruolo di supporto costituito dalla sorveglianza genomica per l’elaborazione di nuove strategie di prevenzione e gestione dell’epidemia.

link al paper:

In order to provide insights into the evolutionary and epidemiological viral dynamics during the current COVID-19 pandemic in South Eastern Italy, a total of 298 genomes of SARS-CoV-2 strains collected in the Apulia and Basilicata regions, between March 2020 and January 2021, were sequenced. The gen...