El servicio de Banco de Sangre y Medicina Transfusional (Hemoterapia), del Hospital Regional "Manuel Núñez Butrón" de Puno, se apertura el 23 de mayo de 1999, en base a la ley N° 26454 promulgada el año de 1995. A la actualidad esta acreditado y registrado con Licencia Sanitaria de funcionamiento, el cual realiza funciones de acuerdo a un Centro de Hemoterapia Tipo II, atendiendo las 24 horas todos los días de la semana; cuenta con las siguientes secciones: Selección, evaluación y extracción sanguínea, fraccionamiento y almacenamiento, sección de inmunohematología, sección de inmunoserología, distribución de unidades y archivo. Además de Jefatura. Obligatoriamente se tamiza el 100% de las unidades de sangre recolectadas, para las principales enfermermedades prevalentes hemotransmisibles; esto mediante la realización de pruebas inmunoserológicas específicas: SIFILIS, HEPATITIS B (Antígeno de superficie y Core), HEPATITIS C, HIV I-II, HTLV I-II y CHAGAS.
